Trasa protokolárního vlaku začíná v Praze Vršovicích, odkud pokračuje průjezdem Prahy přes Prahu Braník a dále pokračuje podél Vltavy do Davle. Poté stoupá údolím řeky Sázavy až do Jílového u Prahy. Za Týncem nad Sázavou překoná řeku Sázavu po ocelovém mostu a strmě stoupá k svému vrcholu u Svárova, odkud klesá zpět do údolí Sázavy u Čerčan. V Čerčanech se připojí k trati Praha – Benešov u Prahy. Mezi Zbraslaví a Jílovým u Prahy vede krásnou krajinou v údolí řek Vltavy a Sázavy s mnoha zajímavými přírodními scenériemi.
Úbočí skal svažujících se na mnoha místech až k řece prochází 7 tunely, z nichž nejdelší je tunel na Jarově o délce 393 m. Před stanicí Jílové u Prahy překonává hlubokou rokli Kocour po vysokém kamenném viaduktu.